Bahagian Pengurusan diketuai oleh Timbalan Pengarah Kesihatan Negeri (Pengurusan) dan dibantu oleh 100 pegawai. Bahagian ini terbahagi kepada 8 unit iaitu:
Objektif Bahagian Pengurusan adalah untuk memastikan perkhidmatan yang diberikan dalam semua bidang pengurusan (sumber manusia, kewangan, pentadbiran, pembangunan, perolehan, aset dan stor, pengurusan maklumat dan psikologi kaunseling) adalah yang terbaik, dipercayai dan berkesan.
Menyokong kepada penyampaian perkhidmatan di Bahagian Pengurusan
Menguruskan dan melaksanakan pengurusan perkhidmatan, perjawatan, HRMIS, Latihan dan Inovasi.
Merancang, melaksana, mengawal dan menilai pengurusan kewangan yang berkualiti
Pembangunan adalah untuk memastikan projek-projek pembangunan dapat dilaksanakan mengikut perancangan dan mencapai outcome yang telah ditetapkan
Memantau Pengurusan Perolehan, Aset Kerajaan dan Stor.
Perkhidmatan sokongan bukan klinikal bagi meningkatkan kesihatan emosi, kualiti dan produktiviti kendiri agar anggota
Perkhidmatan dalam bidang teknologi maklumat kepada semua pihak di Jabatan Kesihatan Negeri Melaka dan PTJ-PTJ dibawahnya